03.05.2023, 8:30 Uhr
Universität Wien
Besprechungsraum 4.34
Währinger Str. 29
1090 Wien

Titel: „Analysis of Gene Expression Data for Precision Medicine
in Ulcerative Colitis“

Kurzfassung:
Personalisierte Medizin versucht abgesehen von der Krankheitsdiagnose andere Faktoren
in die Entscheidungsfindung der Behandlung einzubeziehen. Mit der Entwicklung
von neuen, zunehmend schnellen und kostengünstigen RNA und DNASequenzierungsmethoden,
gibt es völlig neue Möglichkeiten im Bereich der personalisierten
Medizin. Das Prinzip ist, genetische Marker bei der Behandlungsentscheidung
zu nutzen und so auf die genetischen Gegebenheiten der Patient*innen einzugehen.
Dazu müssen Biomarker erforscht werden, die mit dem Ansprechen auf eine Behandlung
in Verbindung stehen. In dieser Arbeit wird mithilfe einer studienübergreifenden
Datenanalyse nach Biomarkern für oder gegen das Ansprechen auf verschiedene
Medikamente bei Colitis Ulcerosa Patient*innen gesucht. Seit ungefähr zwanzig
Jahren hat die Entwicklung von neuen, antikörper-basierte Medikamenten - aus der
Gruppe der Biologika - die Behandlung von Colitis Ulcerosa verändert. Manche
Medikamente wurden bereits besser erforscht, während andere noch am Anfang stehen.
In dieser Arbeit werden alle öffentlich verfügbaren Genexpressionsdaten, die das
Ansprechen auf Biologiker in Colitis Ulcerosa Patient*innen beinhalten analysiert.
Die Analyse umfasst acht verschiedenen Datensätze und sechs verschiedene Medikamente.
Zuerst werden für jedes Medikament differentiell exprimierte Gene vor der
Behandlung zwischen Responder und Nicht-Responder getestet. Weiters werden Machine
Learning Modelle verwendet, um prädiktive Gene für oder gegen das Ansprechen
auf Medikamente zu finden und zu evaluieren. Zuletzt wird die Veränderung von
Genexpression im Laufe der Behandlung zwischen Responder und Nicht-Responder
analysiert. Diese Analysen verschaffen einen breit gefächerten Überblick über das
Ansprechen verschiedener Therapien in Ulcerative Colitis auf Genexpressionsebene
und liefert Ergebnisse, die auf mehreren Ebenen weiter prozessiert werden können,
um diese komplexe Krankheit besser zu verstehen und behandeln zu können.